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GENÔMICA QUANTITATIVA E SELEÇÃO NO MELHORAMENTO DE PLANTAS PERENES E ANIMAIS

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Descrição

A presente publicação aborda métodos quantitativos com aplicações na análise simultânea de dados fenotípicos e de marcadores moleculares.

Contempla o mapeamento de QTLs baseado em análise de ligação e análise de desequilíbrio de ligação, a seleção auxiliada por marcadores moleculares (MAS) em equilíbrio e em desequilíbrio de ligação, a seleção genômica ampla (GWS) e a análise de expressão gênica.

A seleção genômica é uma tecnologia que está revolucionando o melhoramento genético animal e vegetal, propiciando um grande salto qualitativo nos sistemas de avaliação genética.

Essa tecnologia está associada a uma área científica na fronteira do conhecimento, a qual faz uso dos mais recentes avanços da pesquisa.

Essa publicação apresenta uma contribuição ao ensino e difusão da seleção genômica, bem como de outras técnicas associadas. É destinada a estudantes, professores atuantes na área de genética e melhoramento animal e vegetal.

Capítulo 1 - Genética de Populações e Desequilíbrio de Ligação Gênica
1. Fundamentos do Mapeamento de QTLs, da Seleção Auxiliada por Marcadores Moleculares (MAS) e da Seleção Genômica Ampla (GWS) - 15
2. Equilíbrio e Desequilíbrio de Ligação - 18
3. Desequilíbrio de Ligação nas Populações e suas Causas - 21
3.1 Reduzido Tamanho Efetivo Populacional e Deriva Genética - 21
3.2 Mutação - 27
3.3 Migração - 30
3.4 Seleção - 31
4. Estrutura de Populações e Desequilíbrio de Ligaçã - 34
5. Genética Quantitativa Humana: Contribuições - 39
6. Coeficientes e Medidas de Desequilíbrio de Ligação - 44
7. Análise de Ligação (LA) e Análise de Desequilíbrio de Ligação (LDA) - 48
8. Construção de Haplótipos - 51
9. Desequilíbrio de Ligação entre Espécies, Populações e Raças - 52
10. Número de Alelos do QTL - 54

Capítulo 2 - Mapeamento de QTL via Análise de Ligação Gênica (LA)
1. Análise de QTL - 55
2. Funções de Mapeamento - 61
3. Mapeamento de QTL em Plantas Perenes - 63
11. Modelos Estatísticos para Análise de QTL - 66
12. Análise de QTL em Famílias de Irmãos Germanos - 78
13. Estimação da Herdabilidade via Parentesco Genômico – 82

Capítulo 3 - Mapeamento de QTL Via Análise de Desequilíbrio de Ligação Gênica (LDA)
4. Estratégias de Mapeamento via LDA - 85
5. Mapeamento Genômico Amplo via Regressão em Marcas Simples - 87
6. Poder Estatístico e Nível de Significância do Teste de Associação para Detecção de QTL - 90
7. Mapeamento Genômico Amplo via Modelos Mistos Usando Haplótipos - 93
8. Mapeamento Genômico Amplo via Abordagem IBD-LDA - 96
9. Mapeamento Genômico Amplo via Abordagem LDA-LA - 99
10. Mapeamento Genômico Amplo via Abordagem GWS - 101

Capítulo 4 - Seleção Auxiliada por Marcadores em Equilíbrio de Ligação (LE-MAS)
103 Tipos de Seleção via Marcadores Genéticos - 103
104 Seleção com Base em Genes de Efeitos Conhecidos - 104
105 Índice de Seleção na Seleção Auxiliada por Marcadores - 108
106 BLUP de QTL - 113
107 Uso de Genes Identificados e da MAS - 119

Capítulo 5 - Seleção Auxiliada por Marcadores em Desequilíbrio de Ligação (LD-MAS)
1. Estágio Atual das Pesquisas com QTL - 123
2. LD-MAS via Análise de Marcas Simples - 123
3. LD-MAS via Análise de Múltiplos Marcadores ou Regressão de Cumeeira - 128
4. LD-MAS via Análise de Haplótipos - 132
5. LD-MAS via Análise de IBD - 132
6. Número de Locos a ser Usado na LD-MAS - 139

Capítulo 6 - Seleção Genômica Ampla (GWS)
14. Fundamentos da Genome Wide Selection (GWS) - 141
15. Modelos Estatísticos Lineares - 147
16. Modelos Estatísticos de Seleção - 148
17. Métodos Estatísticos de Estimação - 149
18. Acurácia e Variância do Erro de Predição (PEV) - 150
19. Procedimento de Quadrados Mínimos para a GWS (LS/GWS) via Modelos do Tipo I - 154
20. Procedimento REML/BLUP/GWS via Modelos do Tipo III - 158
21. Procedimentos Bayesianos para a Estimação dos Efeitos de Haplótipos - 187
22. Relação entre BLUP Tradicional e BLUP Genômico - 204
23. Implementação da Seleção Genômica Ampla - 206
24. Aspectos Computacionais da Seleção Genômica Ampla - 208

Capítulo 7 - Tamanho Amostral e Acurácia da GWS
11. Acurácia da GWS - 209
12. Tamanho Amostral - 216
13. Número de Marcadores com Efeitos Significativos - 250

Capítulo 8 - Uso Comercial da Seleção Genômica Ampla (GWS)
108 Impacto nas Estratégias de Melhoramento - 255
109 Uso Comercial - 256
110 Resultados Práticos da Seleção Genômica - 260

Capítulo 9 - Componentes de Variância de QTL
7. Métodos de Estimação de Componentes de Variância em Modelos de Efeitos Aleatórios de QTL - 265
8. Método ML pelo Modelo de Haseman e Elston e Fulker e Cardon - 266
9. Método REML pelo Modelo de Fernando e Grossman - 270
10. Método REML pelo Modelo de Goddard - 274
11. Método Bayesiano pelo Modelo de Hoeschele e VanRaden - 275

Capítulo 10 - Genética Quantitativa, Genômica Quantitativa e Transcriptômica Quantitativa
25. Integração entre Três Ciências - 279
26. Uso Simultâneo das Informações dos Marcadores Moleculares e das Expressões Gênicas - 281
27. Software QxPak para Análise de Ligação, Associação e de Expressão Gênica via Modelos Mistos e REML - 284
28. Análise Estatística de Dados de Microarranjos - 296
Referências - 303
Siglas - 329

Autor: Marcos Deon Vilela de Resende
Ano: 2008
Número de Páginas: 330
Tamanho: 17 X 24 cm
Editora: Embrapa
Acabamento: Capa dura
ISBN: 978-85-89281-29-4


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